Trường THCS Bùi Thị Xuân hiện nay là 1 trong 22 trường thuộc Phòng giáo dục đào tạo TP Nha Trang. Sau hai năm đất nước thống nhất, ngày 05/09/1977 nhà trường đã được thành lập.

Với diện tích 1654 m2 trường nằm khiêm nhường trên con đường Trần Phú xinh đẹp đầy nắng và gió biển của thành phố Nha Trang hiền hòa. Tiền thân của trường là trường THCS Vĩnh Nguyên gồm cả cấp 1 và cấp 2. Khóa học đầu tiên chỉ có hai lớp 6 và một lớp 7 với 125 học sinh. Do sự nghiệp giáo dục ngày càng được quan tâm, nhu cầu học tập càng được mở rộng, 05/09/1995 vinh dự mang tên nữ tướng triều Tây Sơn – Trường THCS Bùi Thị Xuân. Trường đã trải qua hơn 35 năm phát triển dưới sự lãnh đạo của 7 đời hiệu trưởng.

*Căn cứ quyết định 1052/ QĐ- UBND- Sáp nhập trường THCS Bùi Thị Xuân và trường THCS Bạch Đằng  thành trường THCS Bùi Thị Xuân kể từ ngày 01/04/2023.